| 8. Spieltag | 08.11.2003 | SC Paderborn 07 [A-Junioren] | - | 1. FC Köln [A-Junioren] | 0:3 | ||||
| 9. Spieltag | 12.11.2003 | 1. FC Köln [A-Junioren] | - | Viktoria Köln [A-Junioren] | 5:1 |  |
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| 10. Spieltag | 22.11.2003 | Rot-Weiss Essen [A-Junioren] | - | 1. FC Köln [A-Junioren] | 0:1 | ||||
| 11. Spieltag | 30.11.2003 | 1. FC Köln [A-Junioren] | - | Bayer Leverkusen [A-Junioren] | 1:3 | ||||
| 12. Spieltag | 07.12.2003 | VfL Bochum [A-Junioren] | - | 1. FC Köln [A-Junioren] | 0:0 | ||||
| 13. Spieltag | 14.12.2003 | 1. FC Köln [A-Junioren] | - | KFC Uerdingen 05 [A-Junioren] | 2:0 | ||||
| 14. Spieltag | 22.02.2004 | 1. FC Köln [A-Junioren] | - | Alemannia Aachen [A-Junioren] | 4:0 | ||||
| 17. Spieltag | 14.03.2004 | 1. FC Köln [A-Junioren] | - | Bor. Mönchengladbach [A-Junioren] | 3:1 |  |
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| 18. Spieltag | 20.03.2004 | SG Wattenscheid 09 [A-Junioren] | - | 1. FC Köln [A-Junioren] | 0:2 | ||||
| 15. Spieltag | 25.03.2004 | Borussia Dortmund [A-Junioren] | - | 1. FC Köln [A-Junioren] | 4:0 |  |
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| 25. Spieltag | 06.06.2004 | 1. FC Köln [A-Junioren] | - | VfL Bochum [A-Junioren] | 1:1 | |
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