| 1. Spieltag | 07.07.1999 | Neuchâtel Xamax FC | - | FC Aarau | 1:1 |  |
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| 8. Spieltag | 14.08.1999 | FC Aarau | - | Lausanne Sports | 1:3 | ||||
| 11. Spieltag | 11.09.1999 | FC Aarau | - | FC Basel 1893 | 1:3 | ||||
| 16. Spieltag | 24.10.1999 | FC Aarau | - | SR Delémont | 4:2 | ||||
| 20. Spieltag | 28.11.1999 | FC Aarau | - | FC Zürich | 1:1 | ||||
| 22. Spieltag | 12.12.1999 | FC Basel 1893 | - | FC Aarau | 2:1 |
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