| 22. Spieltag | 15.02.2025 | Bor. Mönchengladbach II | - | Fortuna Köln | 0:3 | ||||
| 23. Spieltag | 21.02.2025 | Fortuna Köln | - | Wuppertaler SV | 1:0 | ||||
| 24. Spieltag | 01.03.2025 | MSV Duisburg | - | Fortuna Köln | 2:0 | ||||
| 25. Spieltag | 08.03.2025 | Fortuna Köln | - | Sportfreunde Lotte | 1:1 | ||||
| 26. Spieltag | 15.03.2025 | FC Gütersloh | - | Fortuna Köln | 2:2 | ||||
| 18. Spieltag | 19.03.2025 | SV Rödinghausen | - | Fortuna Köln | 1:0 | ||||
| 28. Spieltag | 04.04.2025 | Rot-Weiß Oberhausen | - | Fortuna Köln | 2:0 | ||||
| 29. Spieltag | 12.04.2025 | Fortuna Köln | - | Eintracht Hohkeppel | 4:1 | ||||
| 30. Spieltag | 19.04.2025 | SC Paderborn 07 II | - | Fortuna Köln | 0:0 | ||||
| 31. Spieltag | 26.04.2025 | Fortuna Köln | - | Fortuna Düsseldorf II | 0:2 | ||||
| 33. Spieltag | 10.05.2025 | SC Wiedenbrück | - | Fortuna Köln | 4:2 | ||||
| 34. Spieltag | 17.05.2025 | Fortuna Köln | - | FC Schalke 04 II | 3:0 |
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