| 17. Spieltag | 01.04.1999 | Sportfreunde Siegen | - | Borussia Dortmund II | 2:0 | ||||
| 29. Spieltag | 25.04.1999 | Borussia Dortmund II | - | Eintracht Trier | 1:3 | ||||
| 18. Spieltag | 02.05.1999 | FC Remscheid | - | Borussia Dortmund II | 0:3 | ||||
| 31. Spieltag | 08.05.1999 | 1. FC Saarbrücken | - | Borussia Dortmund II | 1:2 | ||||
| 32. Spieltag | 14.05.1999 | Borussia Dortmund II | - | 1. FC Kaiserslautern II | 1:1 | ||||
| 33. Spieltag | 24.05.1999 | SC Paderborn 07 | - | Borussia Dortmund II | 2:1 |  |
|||
| 34. Spieltag | 30.05.1999 | Borussia Dortmund II | - | Sportfreunde Siegen | 2:1 |
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