| 1. Spieltag | 02.07.2016 | Sagan Tosu | - | FC Tokyo | 3:2 | ||||
| 7. Spieltag | 06.08.2016 | FC Tokyo | - | Júbilo Iwata | 3:2 | ||||
| 9. Spieltag | 20.08.2016 | FC Tokyo | - | Yokohama F. Marinos | 1:0 |  |
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| 15. Spieltag | 22.10.2016 | FC Tokyo | - | Kashima Antlers | 2:1 | ||||
| 16. Spieltag | 29.10.2016 | FC Tokyo | - | Vegalta Sendai | 1:0 |  |
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| 17. Spieltag | 03.11.2016 | RB Omiya Ardija | - | FC Tokyo | 0:1 |
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