| 22. Spieltag | 01.02.2009 | CD Alavés | - | UD Salamanca | 1:1 | ||||
| 23. Spieltag | 08.02.2009 | Córdoba CF | - | CD Alavés | 3:0 | ||||
| 24. Spieltag | 15.02.2009 | CD Alavés | - | Rayo Vallecano | 0:2 | ||||
| 25. Spieltag | 22.02.2009 | Levante UD | - | CD Alavés | 2:3 |  |
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| 26. Spieltag | 28.02.2009 | CD Alavés | - | Real Sociedad | 2:1 | |
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| 27. Spieltag | 07.03.2009 | UD Las Palmas | - | CD Alavés | 2:1 |  |
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| 28. Spieltag | 14.03.2009 | CD Alavés | - | Real Zaragoza | 2:2 | ||||
| 30. Spieltag | 29.03.2009 | CD Alavés | - | Hércules CF | 1:3 | |
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| 31. Spieltag | 05.04.2009 | Elche CF | - | CD Alavés | 1:0 | ||||
| 32. Spieltag | 11.04.2009 | Sevilla Atlético | - | CD Alavés | 1:1 | ||||
| 33. Spieltag | 19.04.2009 | CD Alavés | - | Xerez CD | 1:2 | ||||
| 34. Spieltag | 25.04.2009 | Girona FC | - | CD Alavés | 0:1 | ||||
| 35. Spieltag | 03.05.2009 | CD Alavés | - | CD Castellón | 0:1 | ||||
| 36. Spieltag | 10.05.2009 | Gimnàstic de Tarragona | - | CD Alavés | 1:1 | ||||
| 37. Spieltag | 16.05.2009 | CD Alavés | - | SD Eibar | 1:1 | ||||
| 38. Spieltag | 24.05.2009 | CD Tenerife | - | CD Alavés | 3:0 | ||||
| 39. Spieltag | 30.05.2009 | CD Alavés | - | SD Huesca | 3:0 | |
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| 40. Spieltag | 06.06.2009 | RC Celta | - | CD Alavés | 2:1 | |
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| 42. Spieltag | 20.06.2009 | Albacete | - | CD Alavés | 1:0 |
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