| 1. Spieltag | 16.08.2008 | Hannover 96 II | - | 1. FC Magdeburg | 0:2 |  |
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| 2. Spieltag | 23.08.2008 | Energie Cottbus II | - | Hannover 96 II | 0:2 | ||||
| 3. Spieltag | 30.08.2008 | Hannover 96 II | - | Altona 93 | 0:2 | |
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| 4. Spieltag | 14.09.2008 | Türkiyemspor Berlin | - | Hannover 96 II | 1:2 | ||||
| 5. Spieltag | 20.09.2008 | Hannover 96 II | - | FC Oberneuland | 1:2 | ||||
| 6. Spieltag | 27.09.2008 | Chemnitzer FC | - | Hannover 96 II | 1:1 | ||||
| 7. Spieltag | 04.10.2008 | Hansa Rostock II | - | Hannover 96 II | 1:4 |  |
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| 8. Spieltag | 19.10.2008 | Hannover 96 II | - | Holstein Kiel | 1:3 | ||||
| 9. Spieltag | 24.10.2008 | SV Babelsberg 03 | - | Hannover 96 II | 1:1 | ||||
| 12. Spieltag | 08.11.2008 | Hannover 96 II | - | Hertha BSC II | 4:2 | |
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| 14. Spieltag | 21.11.2008 | Hannover 96 II | - | VFC Plauen | 3:2 |
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