| 25. Spieltag | 03.08.2024 | Yokohama FC | - | JEF United Chiba | 2:1 | ||||
| 26. Spieltag | 10.08.2024 | Yokohama FC | - | V-Varen Nagasaki | 0:0 | ||||
| 27. Spieltag | 17.08.2024 | Thespa Gunma | - | Yokohama FC | 1:2 | ||||
| 28. Spieltag | 24.08.2024 | Yokohama FC | - | Tokushima Vortis | 2:0 |  |
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| 29. Spieltag | 31.08.2024 | Montedio Yamagata | - | Yokohama FC | 1:2 | ||||
| 30. Spieltag | 07.09.2024 | Ehime FC | - | Yokohama FC | 1:4 | ||||
| 31. Spieltag | 15.09.2024 | Yokohama FC | - | Ventforet Kofu | 1:0 | ||||
| 32. Spieltag | 21.09.2024 | Yokohama FC | - | Oita Trinita | 1:1 | ||||
| 33. Spieltag | 28.09.2024 | Shimizu S-Pulse | - | Yokohama FC | 1:1 | |
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| 34. Spieltag | 06.10.2024 | Yokohama FC | - | Kagoshima United | 1:0 | ||||
| 35. Spieltag | 19.10.2024 | Vegalta Sendai | - | Yokohama FC | 3:0 | ||||
| 36. Spieltag | 27.10.2024 | Yokohama FC | - | Fagiano Okayama | 2:4 | ||||
| 37. Spieltag | 03.11.2024 | Yokohama FC | - | Tochigi SC | 0:0 | ||||
| 38. Spieltag | 10.11.2024 | Renofa Yamaguchi | - | Yokohama FC | 0:0 | |
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