| 23. Spieltag | 26.02.2005 | VfL Osnabrück | - | FC St. Pauli | 2:2 |  |
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| 27. Spieltag | 23.03.2005 | FC St. Pauli | - | SC Paderborn 07 | 1:0 | |
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| 28. Spieltag | 26.03.2005 | Arminia Bielefeld II | - | FC St. Pauli | 1:4 | |
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| 29. Spieltag | 01.04.2005 | FC St. Pauli | - | Borussia Dortmund II | 0:0 | ||||
| 24. Spieltag | 05.04.2005 | FC St. Pauli | - | Hamburger SV II | 1:0 | ||||
| 30. Spieltag | 08.04.2005 | Fortuna Düsseldorf | - | FC St. Pauli | 3:0 | ||||
| 31. Spieltag | 15.04.2005 | FC St. Pauli | - | VfB Lübeck | 1:1 | ||||
| 32. Spieltag | 23.04.2005 | Chemnitzer FC | - | FC St. Pauli | 2:0 | ||||
| 33. Spieltag | 28.04.2005 | FC St. Pauli | - | Werder Bremen II | 0:1 | ||||
| 34. Spieltag | 07.05.2005 | Preußen Münster | - | FC St. Pauli | 2:0 |  |
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| 35. Spieltag | 13.05.2005 | FC St. Pauli | - | Eintracht Braunschweig | 2:1 | |
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| 36. Spieltag | 21.05.2005 | VfL Wolfsburg II | - | FC St. Pauli | 2:2 | ||||
| 37. Spieltag | 28.05.2005 | FC St. Pauli | - | KFC Uerdingen 05 | 2:2 | |
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| 38. Spieltag | 04.06.2005 | Hertha BSC II | - | FC St. Pauli | 1:1 |
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