| 19. Spieltag | 21.02.2009 | 1. FC Kaiserslautern II | - | Preußen Münster | 1:1 | ||||
| 20. Spieltag | 28.02.2009 | Preußen Münster | - | VfL Bochum II | 1:2 | ||||
| 22. Spieltag | 13.03.2009 | Preußen Münster | - | Eintracht Trier | 3:2 |  |
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| 23. Spieltag | 21.03.2009 | BV Cloppenburg | - | Preußen Münster | 1:1 |  |
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| 24. Spieltag | 28.03.2009 | Preußen Münster | - | Wormatia Worms | 2:0 | |
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| 21. Spieltag | 01.04.2009 | 1. FC Köln II | - | Preußen Münster | 1:0 | ||||
| 25. Spieltag | 13.04.2009 | SC Verl | - | Preußen Münster | 0:1 | |
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| 26. Spieltag | 19.04.2009 | Rot-Weiss Essen | - | Preußen Münster | 0:4 | ||||
| 28. Spieltag | 01.05.2009 | 1. FC Kleve | - | Preußen Münster | 1:2 | ||||
| 29. Spieltag | 08.05.2009 | Preußen Münster | - | Bor. Mönchengladbach II | 0:1 | ||||
| 30. Spieltag | 12.05.2009 | Bayer Leverkusen II | - | Preußen Münster | 2:1 | ||||
| 31. Spieltag | 15.05.2009 | Preußen Münster | - | SV 07 Elversberg | 1:1 | ||||
| 32. Spieltag | 24.05.2009 | FSV Oggersheim | - | Preußen Münster | 0:2 | ||||
| 34. Spieltag | 06.06.2009 | Sportfreunde Lotte | - | Preußen Münster | 1:2 |
Deutschland