| 1. Spieltag | 07.07.1999 | Neuchâtel Xamax FC | - | FC Aarau | 1:1 | ||||
| 2. Spieltag | 13.07.1999 | FC Aarau | - | Yverdon Sport FC | 1:1 | ||||
| 3. Spieltag | 17.07.1999 | Grasshopper Club Zürich | - | FC Aarau | 4:0 | ||||
| 4. Spieltag | 21.07.1999 | FC Aarau | - | FC St. Gallen | 1:0 | ||||
| 5. Spieltag | 24.07.1999 | SR Delémont | - | FC Aarau | 4:2 | ||||
| 6. Spieltag | 01.08.1999 | FC Aarau | - | Servette FC | 3:2 |  |
|||
| 7. Spieltag | 07.08.1999 | FC Luzern | - | FC Aarau | 2:1 | ||||
| 11. Spieltag | 11.09.1999 | FC Aarau | - | FC Basel 1893 | 1:3 | ||||
| 12. Spieltag | 18.09.1999 | FC Aarau | - | Neuchâtel Xamax FC | 4:1 | ||||
| 13. Spieltag | 26.09.1999 | Yverdon Sport FC | - | FC Aarau | 1:1 | ||||
| 15. Spieltag | 16.10.1999 | FC St. Gallen | - | FC Aarau | 4:1 | |
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