| 1. Spieltag | 23.07.2016 | FC Schaffhausen | - | FC Wil 1900 | 1:0 | ||||
| 2. Spieltag | 30.07.2016 | FC Wil 1900 | - | FC Zürich | 1:1 | ||||
| 6. Spieltag | 27.08.2016 | FC Wohlen | - | FC Wil 1900 | 1:3 | ||||
| 7. Spieltag | 12.09.2016 | FC Winterthur | - | FC Wil 1900 | 3:0 |  |
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| 8. Spieltag | 21.09.2016 | FC Wil 1900 | - | FC Le Mont | 2:0 |  |
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| 9. Spieltag | 24.09.2016 | FC Chiasso | - | FC Wil 1900 | 0:4 | ||||
| 10. Spieltag | 03.10.2016 | FC Wil 1900 | - | FC Schaffhausen | 2:1 | ||||
| 11. Spieltag | 16.10.2016 | FC Aarau | - | FC Wil 1900 | 0:1 | ||||
| 12. Spieltag | 23.10.2016 | FC Wil 1900 | - | FC Winterthur | 5:1 | |
|
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| 13. Spieltag | 31.10.2016 | Servette FC | - | FC Wil 1900 | 2:1 | ||||
| 14. Spieltag | 07.11.2016 | FC Wil 1900 | - | FC Chiasso | 0:0 | ||||
| 15. Spieltag | 20.11.2016 | FC Le Mont | - | FC Wil 1900 | 0:0 | ||||
| 16. Spieltag | 26.11.2016 | FC Wil 1900 | - | FC Wohlen | 1:2 | |
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| 17. Spieltag | 03.12.2016 | FC Zürich | - | FC Wil 1900 | 2:0 | |
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| 18. Spieltag | 10.12.2016 | FC Wil 1900 | - | Neuchâtel Xamax FCS | 0:0 | ||||
| 19. Spieltag | 04.02.2017 | FC Wil 1900 | - | FC Le Mont | 0:0 |
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