| 1. Spieltag | 13.07.2012 | Servette FC | - | FC Basel 1893 | 0:1 | ||||
| 2. Spieltag | 21.07.2012 | FC Basel 1893 | - | FC Luzern | 2:2 | ||||
| 3. Spieltag | 28.07.2012 | Grasshopper Club Zürich | - | FC Basel 1893 | 2:2 |  |
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| 4. Spieltag | 04.08.2012 | FC Sion | - | FC Basel 1893 | 1:1 | ||||
| 6. Spieltag | 18.08.2012 | FC Basel 1893 | - | FC Lausanne-Sport | 2:0 | ||||
| 13. Spieltag | 21.10.2012 | FC Luzern | - | FC Basel 1893 | 1:0 | ||||
| 14. Spieltag | 28.10.2012 | FC Zürich | - | FC Basel 1893 | 1:2 | ||||
| 15. Spieltag | 03.11.2012 | FC Basel 1893 | - | BSC Young Boys | 2:0 | |
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| 16. Spieltag | 18.11.2012 | FC Basel 1893 | - | Grasshopper Club Zürich | 4:0 | ||||
| 20. Spieltag | 17.02.2013 | FC Lausanne-Sport | - | FC Basel 1893 | 1:2 |  |
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| 24. Spieltag | 17.03.2013 | FC Basel 1893 | - | FC Thun | 1:0 | ||||
| 26. Spieltag | 07.04.2013 | FC St. Gallen | - | FC Basel 1893 | 1:1 | |
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