| 1. Spieltag | 17.08.2024 | FC Lausanne-Sport [U16] | - | FC Basel 1893 [U16] | 0:5 |  |
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| 2. Spieltag | 24.08.2024 | FC Basel 1893 [U16] | - | Team Xamax-BEJUNE FA [U16] | 4:2 | ||||
| 3. Spieltag | 31.08.2024 | Grasshopper Club Zürich [U16] | - | FC Basel 1893 [U16] | 2:2 | |
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| 4. Spieltag | 07.09.2024 | FC Basel 1893 [U16] | - | BSC Young Boys [U16] | 5:0 | |
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| 5. Spieltag | 14.09.2024 | Team Ticino [U16] | - | FC Basel 1893 [U16] | 2:5 | ||||
| 7. Spieltag | 05.10.2024 | FC Winterthur [U16] | - | FC Basel 1893 [U16] | 0:4 | |
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| 8. Spieltag | 12.10.2024 | FC Basel 1893 [U16] | - | FCO St. Gallen [U16] | 0:3 | ||||
| 6. Spieltag | 16.10.2024 | FC Basel 1893 [U16] | - | FC Sion [U16] | 5:1 | |
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| 9. Spieltag | 19.10.2024 | FC Aarau [U16] | - | FC Basel 1893 [U16] | 1:5 | ||||
| 10. Spieltag | 26.10.2024 | FC Basel 1893 [U16] | - | FC Zürich [U16] | 9:1 | |
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| 12. Spieltag | 09.11.2024 | FC Thun Berner Oberland [U16] | - | FC Basel 1893 [U16] | 1:3 | |
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| 14. Spieltag | 23.11.2024 | FC Basel 1893 [U16] | - | FC Lausanne-Sport [U16] | 5:1 | |
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| 15. Spieltag | 30.11.2024 | Team Xamax-BEJUNE FA [U16] | - | FC Basel 1893 [U16] | 2:2 |
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