| 11. Spieltag | 02.11.2024 | FC Winterthur [U16] | - | Grasshopper Club Zürich [U16] | 5:0 |  |
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| 13. Spieltag | 16.11.2024 | FC Winterthur [U16] | - | Team Ticino [U16] | 1:3 | ||||
| 15. Spieltag | 30.11.2024 | FC Winterthur [U16] | - | FC Thun Berner Oberland [U16] | 4:1 | |
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| 16. Spieltag | 07.12.2024 | FCO St. Gallen [U16] | - | FC Winterthur [U16] | 1:0 | ||||
| 17. Spieltag | 15.02.2025 | FC Winterthur [U16] | - | FC Aarau [U16] | 4:1 | |
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| 18. Spieltag | 22.02.2025 | FC Zürich [U16] | - | FC Winterthur [U16] | 2:3 | |
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| 20. Spieltag | 08.03.2025 | FC Basel 1893 [U16] | - | FC Winterthur [U16] | 2:3 | ||||
| 21. Spieltag | 15.03.2025 | FC Winterthur [U16] | - | Servette FC [U16] | 2:5 | ||||
| 22. Spieltag | 22.03.2025 | FC Lausanne-Sport [U16] | - | FC Winterthur [U16] | 1:0 | ||||
| 23. Spieltag | 29.03.2025 | FC Winterthur [U16] | - | Team Xamax-BEJUNE FA [U16] | 3:3 | ||||
| 25. Spieltag | 13.04.2025 | FC Winterthur [U16] | - | BSC Young Boys [U16] | 2:1 | ||||
| 19. Spieltag | 17.04.2025 | FC Winterthur [U16] | - | FC Luzern [U16] | 1:1 | ||||
| 14. Spieltag | 23.04.2025 | FC Winterthur [U16] | - | FC Sion [U16] | 4:1 | |
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| 26. Spieltag | 03.05.2025 | Team Ticino [U16] | - | FC Winterthur [U16] | 2:0 |
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