| 2. Spieltag | 19.08.2006 | Borussia Dortmund | - | 1. FSV Mainz 05 | 1:1 |  |
|||
| 3. Spieltag | 27.08.2006 | 1. FSV Mainz 05 | - | Eintracht Frankfurt | 1:1 | ||||
| 4. Spieltag | 16.09.2006 | Energie Cottbus | - | 1. FSV Mainz 05 | 2:0 | ||||
| 5. Spieltag | 23.09.2006 | 1. FSV Mainz 05 | - | Hertha BSC | 1:1 | ||||
| 6. Spieltag | 30.09.2006 | 1. FC Nürnberg | - | 1. FSV Mainz 05 | 1:1 | ||||
| 7. Spieltag | 13.10.2006 | 1. FSV Mainz 05 | - | Alemannia Aachen | 1:3 | ||||
| 8. Spieltag | 21.10.2006 | Arminia Bielefeld | - | 1. FSV Mainz 05 | 1:0 | ||||
| 9. Spieltag | 27.10.2006 | 1. FSV Mainz 05 | - | Werder Bremen | 1:6 | ||||
| 10. Spieltag | 04.11.2006 | Bayer Leverkusen | - | 1. FSV Mainz 05 | 1:1 | ||||
| 11. Spieltag | 07.11.2006 | 1. FSV Mainz 05 | - | VfL Wolfsburg | 1:2 | ||||
| 12. Spieltag | 11.11.2006 | FC Schalke 04 | - | 1. FSV Mainz 05 | 4:0 | ||||
| 13. Spieltag | 18.11.2006 | 1. FSV Mainz 05 | - | Hamburger SV | 0:0 | ||||
| 15. Spieltag | 01.12.2006 | 1. FSV Mainz 05 | - | VfB Stuttgart | 0:0 | ||||
| 16. Spieltag | 09.12.2006 | Bor. Mönchengladbach | - | 1. FSV Mainz 05 | 1:1 |
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