| 22. Spieltag | 22.02.2006 | Hamburger SV II | - | Rot-Weiß Erfurt | 3:0 | ||||
| 25. Spieltag | 25.02.2006 | Kickers Emden | - | Rot-Weiß Erfurt | 0:0 | ||||
| 28. Spieltag | 21.03.2006 | Rot-Weiß Erfurt | - | Rot-Weiß Oberhausen | 0:0 | ||||
| 29. Spieltag | 25.03.2006 | Wuppertaler SV | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:0 | ||||
| 26. Spieltag | 28.03.2006 | Rot-Weiß Erfurt | - | VfB Lübeck | 0:0 | ||||
| 30. Spieltag | 01.04.2006 | Rot-Weiß Erfurt | - | Bayer Leverkusen II | 3:1 |  |
|||
| 32. Spieltag | 15.04.2006 | Rot-Weiß Erfurt | - | Preußen Münster | 1:1 | ||||
| 23. Spieltag | 18.04.2006 | Rot-Weiß Erfurt | - | Werder Bremen II | 1:0 | ||||
| 33. Spieltag | 22.04.2006 | Chemnitzer FC | - | Rot-Weiß Erfurt | 0:1 | ||||
| 34. Spieltag | 29.04.2006 | Rot-Weiß Erfurt | - | FC Carl Zeiss Jena | 0:1 | ||||
| 35. Spieltag | 06.05.2006 | Holstein Kiel | - | Rot-Weiß Erfurt | 0:0 | ||||
| 36. Spieltag | 13.05.2006 | Rot-Weiß Erfurt | - | VfL Osnabrück | 1:1 | ||||
| 37. Spieltag | 20.05.2006 | SG Wattenscheid 09 | - | Rot-Weiß Erfurt | 1:5 |  |
|||
| 38. Spieltag | 27.05.2006 | Rot-Weiß Erfurt | - | Rot-Weiss Essen | 0:1 |
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