| 26. Spieltag | 02.01.2006 | Tranmere Rovers | - | Rotherham United | 3:2 | ||||
| 27. Spieltag | 07.01.2006 | Tranmere Rovers | - | AFC Bournemouth | 0:0 | ||||
| 28. Spieltag | 14.01.2006 | Hartlepool United | - | Tranmere Rovers | 0:0 | ||||
| 29. Spieltag | 21.01.2006 | Tranmere Rovers | - | Southend United | 0:0 | ||||
| 30. Spieltag | 28.01.2006 | Bradford City | - | Tranmere Rovers | 0:0 |  |
|||
| 31. Spieltag | 03.02.2006 | Tranmere Rovers | - | Huddersfield Town | 2:1 | ||||
| 32. Spieltag | 11.02.2006 | Gillingham FC | - | Tranmere Rovers | 1:1 | |
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| 33. Spieltag | 14.02.2006 | Tranmere Rovers | - | Hartlepool United | 0:0 | ||||
| 34. Spieltag | 18.02.2006 | Tranmere Rovers | - | Barnsley FC | 0:1 | ||||
| 35. Spieltag | 25.02.2006 | Oldham Athletic | - | Tranmere Rovers | 1:0 | ||||
| 36. Spieltag | 07.03.2006 | Swindon Town | - | Tranmere Rovers | 1:2 | ||||
| 37. Spieltag | 11.03.2006 | Tranmere Rovers | - | Chesterfield FC | 4:1 | ||||
| 38. Spieltag | 17.03.2006 | Tranmere Rovers | - | Walsall FC | 1:2 |
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