| 27. Spieltag | 09.03.2013 | FV Illertissen | - | FC Augsburg II | 3:0 | ||||
| 28. Spieltag | 16.03.2013 | SpVgg Bayern Hof | - | FC Augsburg II | 3:2 |  |
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| 29. Spieltag | 23.03.2013 | FC Augsburg II | - | SV Heimstetten | 0:2 |  |
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| 31. Spieltag | 06.04.2013 | FC Augsburg II | - | SC Eltersdorf | 1:1 |  |
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| 33. Spieltag | 20.04.2013 | FC Augsburg II | - | FC Ingolstadt 04 II | 1:0 |  |
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| 34. Spieltag | 27.04.2013 | TSV 1860 Rosenheim | - | FC Augsburg II | 2:0 | ||||
| 26. Spieltag | 30.04.2013 | FC Augsburg II | - | Würzburger Kickers | 0:1 | ||||
| 35. Spieltag | 04.05.2013 | FC Augsburg II | - | 1. FC Nürnberg II | 0:3 |
Deutschland