| 2. Spieltag | 28.08.2016 | UCAM Murcia CF | - | Córdoba CF | 1:1 | ||||
| 3. Spieltag | 02.09.2016 | Córdoba CF | - | CD Lugo | 3:3 | ||||
| 4. Spieltag | 11.09.2016 | SD Huesca | - | Córdoba CF | 3:0 | ||||
| 5. Spieltag | 17.09.2016 | Córdoba CF | - | Levante UD | 1:0 | ||||
| 6. Spieltag | 20.09.2016 | AD Alcorcón | - | Córdoba CF | 0:1 | ||||
| 7. Spieltag | 24.09.2016 | Córdoba CF | - | Gimnàstic de Tarragona | 2:0 | ||||
| 8. Spieltag | 01.10.2016 | Real Zaragoza | - | Córdoba CF | 1:1 |  |
|||
| 9. Spieltag | 08.10.2016 | CD Numancia | - | Córdoba CF | 1:1 | ||||
| 10. Spieltag | 16.10.2016 | Córdoba CF | - | Sevilla Atlético | 0:1 | ||||
| 12. Spieltag | 29.10.2016 | Córdoba CF | - | Real Valladolid | 1:1 | |
|||
| 14. Spieltag | 11.11.2016 | Córdoba CF | - | RCD Mallorca | 0:2 | ||||
| 16. Spieltag | 27.11.2016 | Córdoba CF | - | Getafe CF | 1:3 | ||||
| 23. Spieltag | 29.01.2017 | Córdoba CF | - | UCAM Murcia CF | 1:1 | ||||
| 25. Spieltag | 12.02.2017 | Córdoba CF | - | SD Huesca | 0:2 | ||||
| 26. Spieltag | 18.02.2017 | Levante UD | - | Córdoba CF | 3:1 | ||||
| 28. Spieltag | 05.03.2017 | Gimnàstic de Tarragona | - | Córdoba CF | 2:1 | |
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| 40. Spieltag | 28.05.2017 | Córdoba CF | - | Real Oviedo | 4:2 | ||||
| 42. Spieltag | 10.06.2017 | Córdoba CF | - | Girona FC | 2:1 |  |
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