| 1. Spieltag | 31.07.2016 | Eintracht Norderstedt | - | Hannover 96 II | 0:2 | ||||
| 2. Spieltag | 05.08.2016 | VfB Oldenburg | - | Hannover 96 II | 0:2 | ||||
| 3. Spieltag | 13.08.2016 | Hannover 96 II | - | Hamburger SV II | 1:1 | ||||
| 4. Spieltag | 21.08.2016 | SV Eichede | - | Hannover 96 II | 2:3 | ||||
| 5. Spieltag | 27.08.2016 | Hannover 96 II | - | TSV Havelse | 2:2 |  |
|||
| 6. Spieltag | 03.09.2016 | Hannover 96 II | - | U.S.I. Lupo-Martini | 1:4 | ||||
| 7. Spieltag | 11.09.2016 | Eintracht Braunschweig II | - | Hannover 96 II | 0:3 |  |
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| 8. Spieltag | 16.09.2016 | Hannover 96 II | - | ETSV Weiche Flensburg | 1:1 | ||||
| 9. Spieltag | 24.09.2016 | Schwarz-Weiß Rehden | - | Hannover 96 II | 1:1 | ||||
| 11. Spieltag | 09.10.2016 | Germania Egestorf/Langreder | - | Hannover 96 II | 2:3 | ||||
| 14. Spieltag | 29.10.2016 | Hannover 96 II | - | SV Drochtersen/Assel | 1:1 | ||||
| 15. Spieltag | 07.11.2016 | VfL Wolfsburg II | - | Hannover 96 II | 4:0 | |
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| 33. Spieltag | 14.05.2017 | SV Meppen | - | Hannover 96 II | 0:0 | ||||
| 34. Spieltag | 20.05.2017 | Hannover 96 II | - | Lüneburger SK Hansa | 1:0 |
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