| 8. Spieltag | 14.08.1999 | FC Aarau | - | Lausanne Sports | 1:3 |  |
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| 10. Spieltag | 28.08.1999 | FC Lugano | - | FC Aarau | 4:1 | ||||
| 13. Spieltag | 26.09.1999 | Yverdon Sport FC | - | FC Aarau | 1:1 | ||||
| 14. Spieltag | 03.10.1999 | FC Aarau | - | Grasshopper Club Zürich | 2:1 | ||||
| 15. Spieltag | 16.10.1999 | FC St. Gallen | - | FC Aarau | 4:1 | ||||
| 16. Spieltag | 24.10.1999 | FC Aarau | - | SR Delémont | 4:2 | ||||
| 17. Spieltag | 30.10.1999 | Servette FC | - | FC Aarau | 1:1 | ||||
| 18. Spieltag | 07.11.1999 | FC Aarau | - | FC Luzern | 1:0 | ||||
| 19. Spieltag | 20.11.1999 | Lausanne Sports | - | FC Aarau | 3:1 | ||||
| 20. Spieltag | 28.11.1999 | FC Aarau | - | FC Zürich | 1:1 | ||||
| 21. Spieltag | 05.12.1999 | FC Aarau | - | FC Lugano | 0:2 | ||||
| 22. Spieltag | 12.12.1999 | FC Basel 1893 | - | FC Aarau | 2:1 |  |
Schweiz