# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Bayern München II, Deutschland Bayern München II 27 18 5 4 59:24 35 59
2 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 27 17 6 4 54:29 25 57
3 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 27 13 7 7 39:26 13 46
4 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 27 11 12 4 43:32 11 45
5 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 27 12 7 8 46:42 4 43
6 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 27 11 6 10 34:31 3 39
7 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 27 11 5 11 43:46 -3 38
8 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 27 10 7 10 40:34 6 37
9 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 27 10 6 11 41:38 3 36
10 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 27 9 7 11 30:40 -10 34
11 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 27 9 6 12 39:37 2 33
12 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 27 8 8 11 35:40 -5 32
13 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 27 7 10 10 40:48 -8 31
14 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 27 8 5 14 32:42 -10 29
15 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 27 7 6 14 23:45 -22 27
16 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 27 7 5 15 38:53 -15 26
17 FC Pipinsried, Deutschland FC Pipinsried 27 5 8 14 39:60 -21 23
18 FC Ingolstadt 04 II, Deutschland FC Ingolstadt 04 II 27 8 8 11 35:43 -8 -13
  Playoffs
  Relegation
  Abstieg

# Durch den Abstieg der Profimannschaft des FC Ingolstadt 04 in die 3. Liga wurde der FC Ingolstadt 04 II mit 0 Punkten an das Ende der Tabelle gesetzt. Die erspielten Ergebnisse behalten aber ihre Gültigkeit. Das Team lag am Ende der Saison eigentlich mit 45 Punkten auf dem neunten Tabellenplatz.

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