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| 24.09.2016 | 15:00 | PAS Giannina | - | Platanias Chanion | 0:0 (0:0) | |
| 17:15 | Panionios GSS | - | Veria FC | 1:2 (0:2) | ||
| 19:30 | Panetolikos | - | Panathinaikos | 0:0 (0:0) | ||
| 25.09.2016 | 15:00 | PAOK Saloniki | - | Xanthi FC | 0:0 (0:0) | |
| 17:15 | Atromitos | - | Asteras Tripolis | 1:0 (1:0) | ||
| 17:15 | Levadiakos | - | AO Kerkyra | 2:1 (2:0) | ||
| 19:30 | AE Lárissa | - | Olympiakos Piraeus | 1:0 (0:0) | ||
| 26.09.2016 | 18:30 | AEK Athen | - | AEP Iraklis FC | 0:0 (0:0) |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
Platanias Chanion | 5 | 4 | 1 | 0 | 8:4 | 4 | 13 |
| 2 |
|
Olympiakos Piraeus | 5 | 4 | 0 | 1 | 12:4 | 8 | 12 |
| 3 |
|
Panathinaikos | 5 | 3 | 1 | 1 | 8:1 | 7 | 10 |
| 4 |
|
Panionios GSS | 5 | 3 | 1 | 1 | 9:3 | 6 | 10 |
| 5 |
|
AEK Athen | 5 | 2 | 2 | 1 | 8:4 | 4 | 8 |
| 6 |
|
PAS Giannina | 5 | 2 | 2 | 1 | 5:5 | 0 | 8 |
| 7 |
|
PAOK Saloniki | 5 | 3 | 1 | 1 | 5:3 | 2 | 7 |
| 8 |
|
AE Lárissa | 5 | 2 | 1 | 2 | 7:8 | -1 | 7 |
| 9 |
|
Atromitos | 5 | 2 | 1 | 2 | 4:6 | -2 | 7 |
| 10 |
|
AEP Iraklis FC | 5 | 1 | 2 | 2 | 5:5 | 0 | 5 |
| 11 |
|
Panetolikos | 5 | 1 | 2 | 2 | 3:4 | -1 | 5 |
| 12 |
|
AO Kerkyra | 5 | 1 | 1 | 3 | 4:5 | -1 | 4 |
| 13 |
|
Xanthi FC | 5 | 1 | 1 | 3 | 2:8 | -6 | 4 |
| 14 |
|
Asteras Tripolis | 5 | 1 | 0 | 4 | 5:10 | -5 | 3 |
| 15 |
|
Levadiakos | 5 | 1 | 0 | 4 | 4:10 | -6 | 3 |
| 16 |
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Veria FC | 5 | 1 | 0 | 4 | 4:13 | -9 | 3 |
| Champions League Quali. | |
| Playoffs | |
| Abstieg |
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# PAOK wurden vom Verband drei Punkte abgezogen, weil sich der Verein in der letzten Saison weigerte, im Pokalhalbfinale gegen Piräus anzutreten. |
