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| 19.05.2017 | 18:00 | JK Narva Trans | - | Pärnu JK Vaprus | 3:0 (1:0) | |
| 18:30 | FC Flora | - | FC Infonet | 3:0 (1:0) | ||
| 20.05.2017 | 12:00 | FC Levadia | - | JK Tammeka | 2:1 (0:0) | |
| 15:00 | JK Sillamäe Kalev | - | Paide Linnameeskond | 2:0 (0:0) | ||
| 18:00 | Tulevik Viljandi | - | JK Nõmme Kalju | 0:2 (0:0) |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
FC Levadia | 12 | 10 | 2 | 0 | 36:6 | 30 | 32 |
| 2 |
|
FC Flora | 12 | 10 | 2 | 0 | 32:4 | 28 | 32 |
| 3 |
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JK Nõmme Kalju | 12 | 8 | 2 | 2 | 33:12 | 21 | 26 |
| 4 |
|
JK Narva Trans | 12 | 6 | 2 | 4 | 22:16 | 6 | 20 |
| 5 |
|
FC Infonet | 12 | 5 | 2 | 5 | 27:15 | 12 | 17 |
| 6 |
|
Paide Linnameeskond | 12 | 3 | 3 | 6 | 12:31 | -19 | 12 |
| 7 |
|
JK Tammeka | 12 | 2 | 5 | 5 | 12:21 | -9 | 11 |
| 8 |
|
JK Sillamäe Kalev | 12 | 2 | 3 | 7 | 12:23 | -11 | 9 |
| 9 |
|
Tulevik Viljandi | 12 | 2 | 0 | 10 | 7:37 | -30 | 6 |
| 10 |
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Pärnu JK Vaprus | 12 | 1 | 1 | 10 | 10:38 | -28 | 4 |
| Champions League Quali. | |
| Abstieg |
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# Pärnu Linnameskond wurde am 11. Januar 2017 aufgelöst. Die Erstligalizenz ging an Pärnu JK Vaprus. # JK Sillamäe Kalev steht am Ende der Saison 2017 als einziger Absteiger durch Lizenzentzug fest. |
